David Baker: Yeni Proteinler Tasarlayan Amerikalı Biyokimyacı
AlphaFold proteinleri **tahmin** ederken, Baker laboratuvarı yeni proteinler **tasarlıyor**. 30+ yıl Seattle'da, Rosetta yazılımıyla, modern sentetik biyolojinin önde gelen figürü. 2024 Nobel Kimya.
"Doğanın yapmadığı proteinleri yapmak"
David Baker (1962-) — modern sentetik biyolojinin önde gelen figürü. 2024 Nobel Kimya ödülünü Hassabis ve Jumper ile paylaştı.
Erken yaşam
- Doğum: 6 Ekim 1962, Seattle.
- Aile: Akademisyen aile.
- Eğitim:
- Harvard (BSc 1984): felsefe!
- UC Berkeley (PhD 1989): biyokimya.
İlginç: lisans felsefe. Sonra biyokimyaya geçiş.
University of Washington (1993-)
Seattle'da kalmaya karar verdi. 30+ yıl orada Baker laboratuvarı.
Institute for Protein Design kurucu direktörü.
Rosetta yazılımı
1990'larda protein yapısı tahmin etmek için kod yazmaya başladı. Sonra protein tasarımı.
Rosetta@home (2005): kullanıcı bilgisayarlarında dağıtık hesaplama. Yüz milyonlarca CPU saati.
Top7 (2003)
İlk tamamen yeni proteini tasarladı. Doğa'nın yapmadığı bir protein.
Bu, modern sentetik biyolojinin başlangıcı.
Önemli başarılar
Yeni enzimler
Doğal olmayan reaksiyonları yapan enzimler.
Aşı tasarımı
RBD aşıları (COVID-19), şubat aşıları.
İlaç tasarımı
Hedef molekülü tutan yeni proteinler.
Sinyal molekülleri
Hücre sinyallerini değiştiren proteinler.
AI dönüşümü
2020'de AlphaFold 2 patladıktan sonra, Baker laboratuvarı kendi AI sistemini geliştirdi:
RoseTTAFold (2021): AlphaFold 2 alternatifi. Açık kaynak.
RFdiffusion (2023): protein tasarımı için difüzyon modeli. Yeni proteinler üretmek için.
Nobel Kimya 2024
Resmi gerekçe Hassabis-Jumper için protein yapısı tahmini; Baker için protein tasarımı.
Modern sentetik biyolojinin iki yarısı birleşik Nobel.
Kişilik
Baker:
- Çok yönlü: felsefe + biyokimya + bilgisayar bilimi.
- Vizyoner: 30 yıl önce kimsenin inanmadığı protein tasarımına başladı.
- Açık kaynak: Rosetta'yı açık paylaştı.
- Eğitime adanmış: Baker laboratuvarından 100+ doktora.
Ödüller
- Lasker Award (2008).
- Breakthrough Prize (2021).
- Nobel Chemistry (2024).
- National Academy of Sciences üye.
Mirası
- Protein tasarımı: sentetik biyolojinin başlangıcı.
- Rosetta: 30 yıllık yazılım, modern standart.
- RoseTTAFold, RFdiffusion: modern AI biyoloji.
- Top7 (2003): ilk yeni protein.
- Institute for Protein Design: Seattle'da merkez.
Modern sentetik biyoloji devrimi büyük ölçüde Baker laboratuvarının eseri. Tahmin ile tasarım'ın evlenmesi modern biyolojiye yeni bir çağ açıyor.
"Doğa kuralları evrim için yazdı. Biz yeni proteinler için yazıyoruz." Baker'in paradigması.
Etiketler
Kendinizi Test Edin
Cevaplarınız profilinizde istatistik olarak saklanır.
1. David Baker neyle uğraşır?
2. Baker'in akademik yuvası neresidir?
3. Baker'in en ünlü yazılımı nedir?
4. Baker 2024 Nobel Kimya'yı kiminle paylaştı?
5. Top7 (2003) niye önemli?
İlgili Yazılar
Brahmagupta: Sıfıra Kurallar Koyan ve Negatif Sayıları Borç Olarak Tanımlayan 7. Yüzyıl Hintlisi
628 yılında Brahmagupta, sıfırın aritmetiğini ve negatif sayıların kurallarını ilk kez sistematik biçimde yazdı. Borç-mülk metaforuyla negatif sayıları meşrulaştırdı, ikinci dereceden denklem formülünü genelleştirdi.
Bilim TarihiHypatia: İskenderiye'nin Son Büyük Kadın Matematikçisi ve Bir Çağın Sonu
M.S. 4. yüzyıl İskenderiye'sinde, dünyanın en büyük kütüphanesinin gölgesinde bir kadın geometri ve astronomi dersleri veriyordu. Hikâyesi, bir bilim insanının ötesinde, bir çağın bittiğini anlatır.
Bilim TarihiÉtienne Bézout: Fransız Donanmasının Matematik Hocası ve Adı Yanlış Yere Yapışmış Cebirci
Adı bugün her kriptografi dersinde geçen Bézout, hayatta sınava hazırlanan denizci adaylarına ders kitabı yazdı. Ünü, kendi bulmadığı bir teoremden geldi; kendi büyük teoremi ise nesiller boyunca anlaşılamadı.